Al termine del suo processo di ristrutturazione, Brussels Airlines verrà acquisita totalmente dal Gruppo Lufthansa. L'annuncio è stato dato da Christoph Franz, amministratore delegato del vettore tedesco.
Dal settembre 2008 Lufthansa possiede una quota del 45% di Brussels Airlines con un'opzione per il rimanente 55%, valida a partire dal 2011. Lufthansa controlla la compagnia belga tramite SN Airholding: il resto del pacchetto azionario è detenuto da vari soggetti, tra i quali Virgin Group, Fortis, Ing, Suez, Tractebel, Brussels Airport, la Société Régionale d'Investissements Wallone (Sriw) e la Société Régionale d'Investissements Bruxelloise (Srib).
Il gruppo tedesco ha già approvato una linea di credito di 100 milioni di euro per Brussels Airlines, che ha subito lo scorso anno una perdita netta di 60,7 milioni, in calo di 19 milioni rispetto al passivo riportato nel 2011. Nel 2012 la compagnia belga ha trasportato 5,75 milioni di passeggeri, una crescita dell'1% rispetto al 2011.