Aumentano le destinazioni servite dallo scalo di Pisa con 16 nuovi collegamenti di linea diretti, di cui 7 per l'Est europeo. Novità è l'arrivo nello scalo del vettore low cost Wizz Air, che da Pisa opererà voli diretti verso Cluj-Napoca in Romania (operativo dal 12 febbraio), verso Katovice/Cracovia dal 26 marzo 2010, Bucarest dal 12 giugno 2010 e Budapest dal 1 luglio 2010.
Wind Jet, invece, opererà da Pisa gli unici due collegamenti di linea diretti tra la Toscana e la Russia con un volo settimanale per Mosca e San Pietroburgo a partire dal 22 e 29 maggio 2010. Dal canto suo, Ryanair aprirà con due frequenze settimanali la rotta Pisa-Cracovia e dal 24 maggio 2010 opererà il primo volo di linea diretto dalla Toscana per la Grecia, Rodi (2 frequenze settimanali). Il vettore ha anche annunciato che dal 5 aprile 2010 baserà sull'Aeroporto di Pisa un 7° aeromobile e aprirà collegamenti diretti da Pisa verso 12 nuove destinazioni, oltre a Cracovia e Rodi anche Fuerteventura, Barcellona Reus, Fez, Goteborg City, Santander, Malaga ed Alicante. Infine Delta Air Lines ha confermato la ripresa del volo Pisa-New York JFK a partire dall'8 maggio, e da giugno il volo sarà operato con frequenza giornaliera.