Il monopolio di Alitalia e Air One sul mercato "incide sulle scelte dei consumatori" e il controllo del 98% degli slot tra Fiumicino e Linate da parte della nuova compagnia pone "un problema reale di concorrenza che non permette l’entrata di nuovi operatori su tale rotta". A stigmatizzare la posizione "dominante" della nuova Alitalia è il ministero dei trasporti. Nella relazione semestrale al Parlamento sul trasporto aereo e sull’andamento dei processi di liberalizzazione del settore, i tecnici del dicastero guidato da Altero Matteoli rilevano "la posizione dominante di Alitalia in seguito alla fusione con Air One" sulla gran parte delle rotte oggi operate all’interno del territorio italiano.
